Fritz và Greta Tugendhat là người Do Thái, vì thế họ đã dời Tiệp Khắc sang Thụy Sĩ và sau đó sang Venezuela cùng với các con trong năm 1938, ngay trước khi Tiệp Khắc bị chia cắt theo Hiệp ước München. Cặp vợ chồng này đã không bao giờ quay trở về.

Trong thế chiến thứ hai, ngôi biệt thự bị Đức quốc xã chiếm dụng, trong đó họ đặt 1 phòng nghiên cứu cho hãng Messerschmitt (chế tạo máy bay). Sau chiến tranh, biệt thự này do Nga chiếm đóng và đã bị cướp phá nhiều. Năm 1955 biệt thự trở thành tài sản quốc gia. Năm 1963 là trụ sở của Trung tâm giáo dục cải tạo các trẻ em. Sau đó biệt thự đã được sử dụng cho nhiều mục đích thực dụng khác nhau.

Năm 1992 các nhà lãnh đạo chính trị của Tiệp Khắc Vaclav Klaus và Vladimir Meciar đã họp ở đây để ký kết văn bản chính thức chia đôi đất nước thành Cộng hòa Séc và Slovakia. Từ năm 1994, biệt thự này mở cửa cho công chúng vào xem như 1 nhà bảo tàng, do thành phố Brno quản lý.

Năm 2007 các người thừa kế của Fritz và Greta Tugendhat đã chính thức nạp đơn xin trả lại biệt thự, dựa vào 1 luật bảo vệ các công trình nghệ thuật bị tịch thu trong thời Holocaust. Chưa biết kết quả giải quyết ra sao.

Biệt thự này đã được dùng làm biệt thự của tên thủ lĩnh côn đồ trong phim Hannibal Rising quay năm 2007.